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クロロフィルaは、酸素光合成で使用されるクロロフィルの1種類である。スペクトルで紫から青とオレンジから赤の波長からほとんどのエネルギーを吸収し、緑や緑に近い部分はあまり吸収しない。クロロフィルは光を反射しないが細胞壁などの構造により拡散反射された緑色の光が反射光に多く含まれるため、クロロフィル
バクテリオクロロフィル(Bacteriochlorophyll)は、紅色細菌・紅色硫黄細菌に含まれる青緑色色素である。細菌葉緑素、細菌クロロフィルともいう。化学的にはきわめてクロロフィルに似ており、マグネシウムを含むポルフィリンで、クロロフィル同様光のエネルギーを捕えて、これら細菌の光合成に関与する
クロロフィル(イド)bレダクターゼ(chlorophyll(ide) b reductase)は、クロロフィリドb還元酵素(chlorophyllide b reductase)またはクロロフィルb還元酵素(chlorophyll b reductase)として働き、次の酵素反応を触媒する酸化還元酵素である。
鞭毛藻が多く存在している。さらに、これら2つの層の最も重要な違いは、Cyclotella comtaの存在量である。これは、DCMではほとんど発生しない。 表水層のものと比較して、DCMコミュニティではより鞭毛虫(例えば、クリプト藻および渦鞭毛藻)の存在量が多い。鞭毛虫